MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree chromosome

Total Repeats: 24199

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010520	GGA	2	6	1	6	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010520	TAA	2	6	1372	1377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010520	TTAT	2	8	1382	1389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010520	TTG	2	6	1390	1395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010520	ATT	2	6	1468	1473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010520	TTA	2	6	1513	1518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010520	CTA	6	18	1534	1551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010520	TAT	2	6	1555	1560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010520	TCTATT	2	12	1565	1576	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010520	TAA	2	6	1594	1599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010520	AGG	2	6	1600	1605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010520	AAT	2	6	2962	2967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010520	A	6	6	2975	2980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010520	TAT	2	6	2981	2986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010520	TAAT	2	8	2991	2998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010520	AGG	2	6	4396	4401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010520	ATA	2	6	8843	8848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010520	TTA	2	6	8878	8883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010520	A	6	6	8898	8903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010520	ATAA	2	8	8935	8942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010520	AGA	2	6	8956	8961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010520	ATT	2	6	8965	8970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010520	TAT	2	6	8995	9000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010520	ATA	2	6	9005	9010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010520	GAAA	2	8	9054	9061	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010520	A	6	6	9086	9091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010520	GGC	2	6	9288	9293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010520	CTTC	2	8	9325	9332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010520	GCG	2	6	9346	9351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010520	ATA	2	6	9424	9429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010520	GA	3	6	9431	9436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010520	GGTAA	2	10	9501	9510	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010520	GCA	2	6	9598	9603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010520	GCA	2	6	9638	9643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010520	CGC	2	6	9645	9650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010520	TGA	2	6	9656	9661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010520	AGG	2	6	9714	9719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010520	CAG	2	6	9741	9746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010520	GAA	2	6	9933	9938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010520	GGC	2	6	9952	9957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010520	AGC	2	6	10161	10166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010520	GAA	2	6	10196	10201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010520	GGT	2	6	10269	10274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010520	GTC	2	6	10283	10288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010520	TCGTG	2	10	10292	10301	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_010520	TTA	2	6	10340	10345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010520	AGG	2	6	10393	10398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010520	ATC	2	6	10418	10423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010520	AC	3	6	10445	10450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010520	GGTA	2	8	10461	10468	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010520	AC	3	6	10614	10619	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010520	CCT	2	6	10755	10760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_010520	GAA	3	9	10776	10784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010520	TTCT	2	8	10787	10794	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010520	GA	3	6	10821	10826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010520	TC	3	6	10831	10836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010520	GAA	2	6	11028	11033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010520	TAT	2	6	11127	11132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010520	GGA	2	6	11191	11196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010520	AGAA	2	8	11199	11206	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010520	GCG	2	6	11225	11230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010520	AGA	2	6	11291	11296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010520	ACC	2	6	11427	11432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_010520	TAC	2	6	11446	11451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010520	GGA	2	6	11741	11746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010520	CGT	2	6	11854	11859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010520	TAG	2	6	11904	11909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010520	TAAGT	2	10	12030	12039	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010520	AGC	2	6	12086	12091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010520	ACC	2	6	12165	12170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_010520	AGGT	2	8	12629	12636	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010520	GAG	2	6	12637	12642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010520	GAA	2	6	12661	12666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010520	CGG	2	6	12884	12889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010520	TGCT	2	8	13016	13023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010520	ACC	2	6	13155	13160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010520	CGG	2	6	13183	13188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010520	CCT	2	6	13243	13248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_010520	CG	3	6	13296	13301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010520	GGT	2	6	13379	13384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010520	TCG	2	6	13494	13499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010520	CGT	2	6	13574	13579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010520	GAG	2	6	13623	13628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010520	GAA	2	6	13798	13803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010520	TAA	2	6	13860	13865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010520	AAAAT	2	10	13881	13890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010520	GA	3	6	13906	13911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010520	A	7	7	13918	13924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010520	A	6	6	13951	13956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010520	CCA	2	6	14172	14177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_010520	CCA	2	6	14251	14256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010520	T	7	7	14295	14301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010520	A	6	6	14312	14317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010520	TAA	2	6	14337	14342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010520	ATT	2	6	14349	14354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010520	TAA	2	6	14369	14374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010520	TA	3	6	14380	14385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010520	TA	4	8	14440	14447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010520	GGT	2	6	14877	14882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010520	ATA	2	6	19267	19272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010520	TAAT	2	8	19277	19284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010520	T	6	6	19327	19332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010520	ATA	2	6	19357	19362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010520	TA	3	6	19367	19372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010520	AATT	2	8	19376	19383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010520	GA	3	6	20179	20184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010520	AGG	2	6	21600	21605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010520	TTA	2	6	22024	22029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010520	AG	3	6	22093	22098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010520	AAC	2	6	22118	22123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010520	AG	3	6	22188	22193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010520	T	7	7	22260	22266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010520	AGG	2	6	22295	22300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010520	TATT	2	8	22304	22311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010520	AATA	2	8	22321	22328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010520	ATT	2	6	23623	23628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010520	TA	4	8	23643	23650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010520	TTTAA	2	10	23651	23660	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010520	ATTAA	2	10	23671	23680	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010520	TAT	2	6	23710	23715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010520	TAAA	2	8	23720	23727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010520	TATTT	2	10	23743	23752	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010520	TAA	3	9	23763	23771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010520	AAT	2	6	23863	23868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010520	GA	3	6	23893	23898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010520	TC	3	6	23972	23977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010520	T	8	8	24119	24126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010520	A	7	7	24132	24138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010520	TTA	2	6	24162	24167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010520	AAT	2	6	24240	24245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010520	ATTT	2	8	24275	24282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010520	AGATTT	2	12	24290	24301	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010520	TA	4	8	24308	24315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010520	AAT	2	6	24316	24321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010520	AT	3	6	24330	24335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010520	AT	3	6	24340	24345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010520	TTA	2	6	24364	24369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010520	A	7	7	24390	24396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010520	GA	3	6	24401	24406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010520	TC	3	6	24480	24485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_010520	TA	3	6	24495	24500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010520	TAT	2	6	24633	24638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010520	AT	3	6	24673	24678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010520	ATAA	2	8	24762	24769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010520	A	6	6	25687	25692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010520	ATAAG	2	10	25709	25718	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010520	ATT	3	9	25722	25730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010520	ATT	2	6	25733	25738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010520	CAA	2	6	25748	25753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_010520	TAA	2	6	25756	25761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010520	ATA	2	6	25764	25769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010520	ATA	2	6	25773	25778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010520	CT	3	6	27404	27409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_010520	TAAA	2	8	27434	27441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010520	CCT	2	6	27800	27805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_010520	AT	3	6	27814	27819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010520	TAC	2	6	27822	27827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_010520	TAAAT	2	10	27844	27853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_010520	ATT	2	6	27855	27860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_010520	ATT	2	6	27880	27885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_010520	AT	3	6	27911	27916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_010520	AAT	2	6	27929	27934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_010520	TAA	2	6	27944	27949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_010520	AGC	2	6	27999	28004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_010520	T	6	6	28082	28087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_010520	T	6	6	28089	28094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010520	ATA	3	9	28099	28107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_010520	ATATA	2	10	28132	28141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_010520	ATA	2	6	28144	28149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_010520	TAT	2	6	28152	28157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_010520	A	7	7	29751	29757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_010520	TA	3	6	29823	29828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_010520	TAT	2	6	29845	29850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_010520	TAA	2	6	29857	29862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_010520	A	6	6	31108	31113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_010520	TAAA	2	8	31158	31165	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_010520	A	7	7	31163	31169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_010520	ATA	2	6	31177	31182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_010520	TA	3	6	31184	31189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_010520	AATA	2	8	31190	31197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_010520	TAA	2	6	31683	31688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_010520	TATT	2	8	31705	31712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_010520	TAA	2	6	31714	31719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_010520	ATATT	2	10	31741	31750	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_010520	TTA	2	6	31763	31768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_010520	AATAA	2	10	31799	31808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_010520	CT	3	6	31903	31908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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196	NC_010520	ATT	2	6	32277	32282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_010520	TTCT	2	8	44188	44195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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281	NC_010520	TC	3	6	44232	44237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
282	NC_010520	GAA	2	6	44429	44434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_010520	GGA	2	6	44592	44597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_010520	GCG	2	6	44626	44631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_010520	AGA	2	6	44692	44697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_010520	ACC	2	6	44828	44833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_010520	TAC	2	6	44847	44852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_010520	GGA	2	6	45142	45147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_010520	TAG	2	6	45305	45310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_010520	TAAGT	2	10	45431	45440	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_010520	AGGT	2	8	46030	46037	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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